Procesamiento de datos acústicos estacionarios en SonoBat

Desplácese hacia abajo para obtener una guía detallada sobre cómo asignar ID de especies automatizadas a las grabaciones, depurar archivos de ruido, atribuir metadatos a las grabaciones y exportar metadatos en la plantilla de carga masiva de NABat.

Procesamiento de datos acústicos estacionarios en SonoBat

Archivos de atributos

  1. Abra el Asistente de datos de SonoBat y seleccione "Atributo NABat" en el menú desplegable en la parte superior izquierda de la ventana. Para los usuarios con versiones anteriores de SonoBat que no cuentan con el atributo NABat, seleccione "Archivos de atributos". Haga clic en la carpeta en la parte superior derecha de la ventana y navegue hasta la carpeta que contiene los archivos que desea atribuir (debe ser una carpeta para una sola implementación). A continuación, especifique un directorio de salida para guardar los archivos finales haciendo clic en la carpeta en la sección "Carpeta de salida" (también hay una opción para "cambiar el nombre y el atributo en su lugar"). Observe que el panel derecho de la aplicación se llena con una visualización de los metadatos GUANO existentes en el archivo. Esto se ampliará con campos de metadatos NABat.

  2. Para las versiones de SonoBat que incluyen el atribuidor automático de metadatos de NABat, haga clic en el botón "Metadatos de NABat" e ingrese los metadatos en la ventana emergente que aparece. Luego continúe con el paso 4.

  3. Para los usuarios con versiones anteriores de SonoBat que no incluyen el atribuidor NABat, debe agregar manualmente los campos de metadatos para los que tiene datos siguiendo las instrucciones a continuación:

    • Para agregar manualmente un nuevo campo de metadatos, haga clic en uno de los triángulos desplegables amarillos y seleccione "agregar nuevo ..."

    • En el menú emergente, ingrese uno de los nombres de campo de NABat GUANO exactamente como aparece aquí (incluya también NABat |).

    • Haga clic en el menú desplegable en la esquina inferior izquierda de la ventana y seleccione "Crear campo de metadatos avanzados" de las opciones disponibles.

    • Ingrese el valor para ese campo y haga clic en "Aceptar".

    • Repita los pasos anteriores para todos los campos de metadatos de NABat para los que tiene datos.

  4. Una vez que haya agregado todos los metadatos NABat requeridos (y cualquier otro metadato que haya recopilado), haga clic en el botón "Archivos de atributos" en la parte inferior central de la ventana. Deberá completar este proceso una vez para cada implementación de detector, pero los campos de metadatos que agregó manualmente (en versiones sin el atributo automático NABat) estarán disponibles sin volver a agregarlos.

Cambiar el nombre de los archivos

Los usuarios de SonoBat con versiones de software que incluyen el atributo automático NABat, pasan a la siguiente sección (Eliminación de ruido). Estas versiones de software cambiarán automáticamente el nombre de los archivos según los metadatos agregados por el usuario.

  1. Si el modelo de detector que está utilizando incrusta automáticamente una marca de tiempo en los archivos de llamadas, "Marca de tiempo" debería aparecer en la lista de metadatos de archivo en la mitad derecha del Asistente de datos de SonoBat. Si es así, puede omitir el proceso de cambio de nombre del archivo. Sin embargo, antes de cargar metadatos en NABat, los usuarios deben asegurarse de que la columna "Tiempo de grabación de audio" del CSV de metadatos exportados contenga valores. De lo contrario, los nombres de archivo deben adherirse al formato de nomenclatura NABat que se describe a continuación.

    • GRTS ID_LOCATION NAME_RECORDING DATE_TIMESTAMP.wav / zc

  2. Si sus archivos no contienen una marca de tiempo incrustada, seleccione la opción "Editor de nombre de archivo" del menú desplegable en la parte superior izquierda de la ventana del Asistente de datos de SonoBat para agregar los componentes Grid Cell GRTS ID y Site Name como un prefijo a los nombres de archivo. Esto quita el texto antes de la fecha y hora y agrega un nuevo prefijo. Sin embargo, el sistema puede separar el nuevo prefijo y el sello de fecha con un guión en lugar de un guión bajo. Todos los campos DEBEN estar separados por un guión bajo. Esto se puede corregir usando la función "renombrar con comodines", disponible en el menú desplegable sobre el cuadro de prefijo.

  3. Utilice la opción "renombrar con comodines" para realizar una función de "buscar y reemplazar" para reemplazar cualquier carácter que entre en conflicto con el formato de nomenclatura de archivos NABat. Ingrese el texto que desea reemplazar en el campo "patrón de búsqueda" y el texto con el que desea reemplazarlo en el campo "reemplazar patrón de búsqueda con". Se proporciona una vista previa de los nombres de los archivos resultantes para que pueda modificar la fórmula antes de realizar los cambios finales. Haga clic en "Editar nombres de archivo" cuando esté listo para actualizar los nombres de archivo. Es posible que deba realizar varias ejecuciones de cambio de nombre de archivos para lograr el formato deseado.

Limpiar archivos de ruido

  1. Haga clic en el icono de la carpeta en la esquina superior derecha de la ventana del Asistente de datos y navegue hasta la carpeta que contiene sus archivos .wav.

  2. Haz clic en el menú desplegable en la parte superior izquierda y selecciona "Limpiador de archivos por lotes".

  3. Seleccione "medio" de las opciones de filtro y asegúrese de seleccionar el filtro de frecuencia adecuado.

  4. Haga clic en "Scrub" en la parte inferior izquierda de la ventana.

Asignar ID de especies

  1. Abra SonoBat Universal y haga clic en el botón "SonoBatch" en la esquina inferior izquierda.

  2. Haga clic en el icono de la carpeta en la parte superior central de la ventana y navegue hasta la carpeta que contiene los archivos que desea procesar.

  3. Seleccione el clasificador más apropiado para su ubicación usando los menús desplegables en el lado izquierdo de la ventana.

  4. Asegúrese de "¿Agregar códigos de especies a los nombres de archivo?" no está seleccionado.

  5. Seleccione "autofiltro" en áreas sin especies de murciélagos de baja frecuencia y "auto-bajo" en áreas con presencia de murciélagos de baja frecuencia.

  6. Establezca la "calidad de llamada aceptable" en 0,80.

  7. Establezca el "umbral de decisión de sqnc" en 0,90.

  8. Establezca el "número máximo de llamadas a considerar" en 16.

  9. Haga clic en "Procesar" en la parte inferior central de la ventana.

Exportar metadatos a la plantilla de carga masiva de NABat

Los siguientes pasos se pueden utilizar para exportar metadatos de todas las implementaciones procesadas simultáneamente, lo que da como resultado un único CSV con metadatos de numerosos sitios. Simplemente seleccione la carpeta principal que contiene todas sus implementaciones procesadas y siga los pasos que se describen a continuación. La presencia de archivos que no sean .wav en la carpeta no interferirá con este proceso. SonoBat ignorará los archivos que no sean .wav.

  1. Abra SonoBat universal y haga clic en el botón "SonoVet" en la esquina inferior izquierda.

  2. Haga clic en el botón "Agregar al proyecto" en la ventana de Project Vetter y navegue hasta la carpeta que contiene los archivos .wav que han sido procesados, renombrados y que contienen todos los metadatos requeridos. NABat solicita que los usuarios proporcionen metadatos para los archivos NOISE depurados. Sin embargo, SonoBat ignora automáticamente cualquier carpeta etiquetada como "Archivos de ruido", "Archivos eliminados" o "Archivos eliminados". Para garantizar que los archivos borrados se carguen en la tabla de SonoVet, cambie el nombre de las carpetas que contienen archivos borrados a "NOTBAT" antes de cargar las carpetas en SonoVet.

  3. Haga clic en la pestaña "Configuración" en la barra de menú superior y luego haga clic en el botón "Cargar diseño" para cargar el formulario de metadatos NABat. Asegúrese de seleccionar el formulario SonoBat apropiado para su versión de software. Los formularios del proyecto SonoBat están disponibles para descargar aquí .

  4. Haga clic en la pestaña "Tabla de verificación" de la barra de menú superior. Asegúrese de que todos los campos obligatorios tengan valores y de que se completen todos los campos para los que ha introducido datos.

  5. Si todo está correcto, haga clic en la pestaña "Exportar" de la barra de menú superior. Seleccione una carpeta de destino para guardar el archivo de metadatos y seleccione "Salida nula como" "o" Salida nula como una celda vacía "" en el menú desplegable en la parte inferior central de la ventana.

  6. Haga clic en "Guardar en archivo".

  7. El archivo .txt resultante debe convertirse a un archivo .csv. Para convertir el archivo en Excel, abra un nuevo libro de trabajo, haga clic en la pestaña Datos, "Obtener datos", "Desde archivo", "Desde texto / CSV". NOTA:dependiendo de su versión de Excel, el proceso puede variar levemente.

  8. En la ventana emergente, navegue hasta el archivo de texto de SonoBat y haga clic en "Importar". Seleccione "Pestaña" como "Delimitador" y haga clic en "Cargar" en la parte inferior derecha de la ventana. Sus datos ahora se abrirán en una hoja de cálculo de Excel.

  9. Para que el sistema NABat lea sus metadatos, los encabezados de columna creados por SonoBat deben reemplazarse con los nombres de los campos de metadatos de la plantilla NABat. Para hacerlo:

    • Seleccione y copie todos los encabezados de columna separados por comas de la siguiente tabla.

    • Seleccione la celda A1 de su hoja de cálculo y pegue los nuevos encabezados de columna.

    • Haga clic en la pestaña "Datos" en Excel.

    • Seleccione el botón "Texto en columnas".

    • En el cuadro de diálogo, seleccione "Delimitado" como tipo de archivo y haga clic en "Siguiente".

    • Seleccione "Coma" como "Delimitadores" y haga clic en "Finalizar".

    • Los encabezados ahora deberían distribuirse en las columnas apropiadas.

  10. La versión de software específica ahora debe agregarse manualmente. Resalte la columna "Tipo de software" y, utilizando la función de buscar / reemplazar, reemplace "SonoBat" por "SonoBat 3.x", "SonoBat 4.2" o "SonoBat 4.x", según la versión de software específica.

  11. Haga clic en Archivo, Guardar como, seleccione la carpeta donde desea guardar la hoja de cálculo de metadatos, asigne al archivo un nombre único y descriptivo y seleccione "CSV (delimitado por comas)" en el menú desplegable "Guardar como tipo".

  12. Sus metadatos ya están listos para cargarse en el Portal de socios de NABat.

Tabla 1. Encabezados de columna de metadatos NABat para levantamientos acústicos estacionarios.

| GRTS ID de celda, nombre de ubicación, latitud, longitud, hora de inicio de la encuesta, hora de finalización de la encuesta, detector, número de serie del detector, micrófono, número de serie del micrófono, orientación del micrófono, altura del micrófono (metros), distancia al desorden más cercano (metros), tipo de desorden , Distancia al agua más cercana (metros), Tipo de agua, Porcentaje de desorden, Tipo de hábitat amplio, Código de unidad terrestre, Contacto, Resistente al clima, Sucesos inusuales, Temperatura baja nocturna, Temperatura alta nocturna, Humedad relativa baja por la noche, Humedad relativa alta por la noche, Humedad relativa alta por la noche, Por la noche Evento de clima bajo, Evento de clima alto por la noche, Velocidad del viento baja por la noche, Velocidad del viento alta por la noche, Nubosidad baja por la noche, Cubierta de nubes alta por la noche, Nombre de grabación de audio, Tiempo de grabación de audio, Tipo de software, Identificación automática, Identificación manual, Lista de especies