Procesamiento de datos de transectos móviles en Kaleidoscope Pro

Desplácese hacia abajo para obtener una guía detallada sobre cómo asignar ID de especies automatizadas a las grabaciones, depurar archivos de ruido, atribuir metadatos a las grabaciones y exportar metadatos en la plantilla de carga masiva de NABat.

Procesamiento de datos de transectos móviles en Kaleidoscope Pro

  1. Abra Kaleidoscope y haga clic en "Examinar" para seleccionar el directorio de entrada de la carpeta que contiene sus archivos .wav / .zc. Seleccione la casilla junto al tipo de archivos de entrada (WAV / ZC). NOTA:para poder insertar y exportación de metadatos, transectos móviles deben ser procesados de forma individual. Seleccione una carpeta que contenga datos para un solo transecto móvil.

  2. Descargue los formularios de metadatos NABat requeridos aquí (NABat_Metadata_Form_‌Kaleidoscope_Mobile.xml para usar con los pasos 1-9 a continuación y NABat_Mobile_Meta_Output_Only‌_KPRO.xml para usar con los pasos 12-18 a continuación). A continuación, haga clic en el menú desplegable sobre el "Formulario de proyecto predeterminado" y seleccione "Agregar o reemplazar un formulario de proyecto". Navegue a NABat_Metadata_Form_‌Kaleidoscope_Mobile.xml y seleccione el archivo. El formulario de metadatos NABat ahora se cargará en la parte inferior de la sección INPUTS (la mitad izquierda de la ventana Kaleidoscope).

  3. Complete todos los campos de metadatos para los que tiene datos. Los campos obligatorios incluyen Nombre de la ubicación, Hora de inicio de la encuesta, Hora de finalización de la encuesta, Tipo de software y Lista de especies. Algunos campos requieren un formato específico. Pase el puntero sobre un campo para dar formato a sugerencias y / o una lista de entradas aceptadas. La información espacial de la ruta debe cargarse o dibujarse antes de completar estos pasos y cargar metadatos. Aquí encontrará orientación para proporcionar datos espaciales para la ruta. Asegúrese de que el "Nombre de la ubicación" que proporcione con los metadatos de la llamada coincida con el nombre del objeto espacial que cargue o cree.

    • Si su transecto móvil pasa por> 1 celda y tiene un registro de la ubicación X, Y donde se registró cada llamada (usando un GPS externo o un detector habilitado para GPS), deje el campo de ID de celda GRTS en blanco. El sistema NABat utilizará las ubicaciones X, Y para asignar automáticamente la celda GRTS correcta a cada llamada. De lo contrario, las llamadas grabadas fuera de la celda principal producirán un error de discrepancia entre latitud y longitud / ID de GRTS. Si Latitud y Longitud están incrustadas en sus archivos de llamadas, el formulario de metadatos de Kaleidoscope extraerá esos valores y completará automáticamente la salida de metadatos. Si los valores de latitud y longitud se descargaron de una unidad GPS, consulte el paso 17.

    • Si no puede proporcionar la ubicación X, Y donde se registró cada archivo, el sistema NABat puede estimar la ubicación en función de la información espacial proporcionada por el usuario para la ruta, las marcas de tiempo de cada archivo y las horas de inicio / finalización de la encuesta. En este caso, es fundamental que los usuarios proporcionen un objeto espacial para la ruta antes de cargar los metadatos, se aseguren de que se proporcionen marcas de tiempo para cada archivo, proporcionen las horas de inicio y finalización de la ruta y dejen en blanco la columna GRTS Cell ID de la carga de metadatos. .

  4. Una vez que se hayan completado todos los campos de metadatos obligatorios (y cualquier campo adicional para el que tenga datos), seleccione el directorio de salida deseado para guardar los archivos procesados ​​haciendo clic en "Examinar" en la parte superior derecha de la ventana.

  5. A continuación, elija "Todas las noches" del menú desplegable "Crear subdirectorios" si desea mantener los archivos nuevos organizados por noche de detector. Seleccione el tipo de archivos de salida que desea crear, WAV o ZC (los archivos ZC no se pueden convertir a WAV). Para exportar metadatos con éxito, debe seleccionar archivos WAV o ZC en la ventana SALIDAS y crear copias de los archivos originales durante este paso.Estas copias contendrán metadatos incrustados que serán la fuente de la hoja de cálculo de salida "meta" que cargará en NABat.

    • Los usuarios con archivos de cruce por cero que terminan en la extensión. # En lugar de .zc deben seleccionar las opciones "Nombres de archivo 8.3" y "Usar .zc en lugar de. ?? #" debajo de "Archivos ZC". De lo contrario, Kaleidoscope eliminará los segundos desde el nombre del archivo, lo que aumenta la probabilidad de que los nombres de archivos duplicados (como resultado de archivos únicos registrados en el mismo minuto) que creará errores al cargar los metadatos de la base de datos nabat.

  6. Haz clic en la pestaña "Auto ID para murciélagos" en la parte superior de la ventana. Seleccione "Murciélagos de América del Norte" del menú desplegable "Clasificadores" y seleccione su estado / región en el menú desplegable debajo de la lista de especies. Las especies se pueden agregar o eliminar manualmente en función del conocimiento específico de los conjuntos de especies en su área, pero esto debe reflejarse en su lista de especies NABat .

  7. Haga clic en "Procesar archivos" en la esquina inferior derecha de la ventana.

  8. Cuando Kaleidoscope haya terminado de procesarse, revise las identificaciones automatizadas y confirme o rebaje la ID de Kaleidoscope (ID manual). Para los transectos móviles, la guía NABat requiere la verificación manual de todos los archivos de llamadas para estimar la abundancia.

  9. Si su modelo de detector incrusta automáticamente una marca de fecha / hora en las grabaciones, estos datos deben completarse automáticamente y aparecer en la columna "Tiempo de grabación de audio" de la salida "meta" de Kaleidoscope. Si es así, puede omitir el proceso de cambio de nombre del archivo. Sin embargo, antes de cargar metadatos a NABat, debe asegurarse de que la columna "Tiempo de grabación de audio" contenga datos. De lo contrario, los nombres de archivo deben adherirse al formato de nomenclatura NABat y los usuarios deben seguir las instrucciones del paso 10. Si la columna "Tiempo de grabación de audio" se completa automáticamente, puede pasar al paso 11.

  10. Para cambiar el nombre de los archivos, abra NABat F ile Renamero descargue elscript R para cambiar el nombre de los archivos acústicos. Si usa NABat File Renamer, navegue hasta la carpeta que contiene los archivos que acaba de crear con metadatos e ID (será una subcarpeta dentro de la carpeta de salida del paso 4). Cambie el nombre de todos los archivos para asegurarse de que sean coherentes con el formato de nomenclatura de NABat y para eliminar el _000 adjunto por Kaleidoscope.

    • Formato de nomenclatura NABat: GRTSID_SITENAME_YYYYMMDD_HHMMSS.wav / zc. Orientación más detallada sobre el cambio de nombre de archivos acústicos está disponibleaquí.

  11. Repita los pasos del 1 al 10 para todos los transectos que desee procesar. Una vez completados, los pasos 12-24 permitirán a los usuarios exportar simultáneamente metadatos para todos los transectos procesados ​​en un solo CSV de carga masiva.

  12. Regrese a la ventana de procesamiento por lotes, haga clic en "Examinar" en la ventana "Directorio de entrada" y seleccione la carpeta principal que contiene todos los transectos procesados ​​(los nuevos archivos creados con metadatos e ID de especies en los pasos 1-10). Seleccione un nuevo directorio de salida. Si la casilla junto a "Archivos WAV" o "Archivos ZC" aún está marcada, desmarque la casilla (esta vez no creará archivos nuevos, solo un archivo "meta.csv" que contenga metadatos NABat).

  13. Haz clic en la pestaña "Auto ID para murciélagos" y selecciona "DESHABILITADO" en el menú desplegable "CLASIFICADORES".

  14. Reemplace el archivo NABat_Metadata_Form_Kaleidoscope_Mobile.xml del paso 2 con NABat_Mobile_Meta_Output_Only_KPRO.xml. La ventana de entrada de datos ya no incluirá campos de metadatos NABat; sin embargo, el formulario seguirá exportando los metadatos incrustados de los pasos 1-9.

  15. Haga clic en "Procesar archivos" en la esquina inferior derecha de la ventana.

  16. Navegue hasta la carpeta del directorio de salida actual y abra el archivo "meta". Verifique para asegurarse de que todos los campos para los que ingresó datos estén llenos y asegúrese de que las columnas Auto Id / Manual Id estén llenas.

  17. Los usuarios que guardaron la latitud y la longitud de las grabaciones con una unidad GPS externa deben agregar manualmente ubicaciones X, Y a la hoja de cálculo de metadatos masiva. Para comenzar, descargue el archivo de ubicaciones de su unidad GPS. Por lo general, tiene la forma de un archivo de texto con columnas para el nombre del archivo, la latitud y la longitud. Los usuarios con detectores habilitados para GPS que incorporan ubicaciones X, Y en archivos de llamadas (las columnas de latitud / longitud de su CSV ya contendrán datos) pueden pasar al paso 24.

  18. Importe el archivo de texto GPS a Excel:

    • Abra una nueva hoja de cálculo. Haga clic en la pestaña "Datos" y luego seleccione "Obtener datos",luego "Desde archivo" y finalmente "Desde texto / CSV".

    • Navega hasta tu archivo de texto GPS y haz clic en "Abrir".

    • Aparecerá un cuadro de diálogo con una vista previa de los datos a importar. Los archivos de texto GPS suelen estar delimitados por tabulaciones. Si sus datos están ordenados correctamente en columnas, haga clic en "Cargar". De lo contrario, use el menú desplegable "Delimitador" para seleccionar el delimitador apropiado y haga clic en "Cargar".

  19. Cuando sus datos se cargan en una hoja de cálculo de Excel, haga clic en el botón "Ordenar y filtrar" (en la pestaña Inicio) y seleccione "Orden personalizado".

  20. En el cuadro de diálogo, seleccione la columna que contiene sus nombres de archivo para "Ordenar por".

  21. A continuación, abra el CSV que contiene los metadatos de su transecto. Siga los pasos 19-20 para ordenar el documento de metadatos por la columna Nombre de la grabación de audio.

  22. Los dos documentos de Excel (CSV de metadatos y hoja de cálculo GPS) ahora deberían estar ordenados por nombre de archivo. Verifique dos veces para asegurarse de que las columnas del nombre de archivo coincidan.

  23. Si los documentos están ordenados correctamente, ahora puede copiar y pegar las columnas de latitud y longitud del archivo GPS en el CSV de metadatos. Seleccione las columnas de latitud y longitud del documento GPS. Resalte las columnas de latitud y longitud, haga clic con el botón derecho y seleccione "Copiar". A continuación, seleccione la celda Latitude de la primera llamada para la implementación, haga clic con el botón derecho y seleccione "Pegar". Las columnas de latitud y longitud ahora deberían llenarse con los valores correspondientes.

  24. Cambie el nombre del archivo de metadatos con un nombre descriptivo y único y guárdelo ( el sistema NABat sobrescribirá automáticamente los nombres de archivo duplicados con la versión más reciente, por lo que es fundamental que su nombre de archivo sea único ).

  25. El archivo de metadatos ahora está listo para cargarse en su proyecto NABat.